Laboratoř ekologie fytoplanktonu a nádržové limnologie je součástí Oddělení mikrobiální ekologie vody na Hydrobiologickém ústavu Biologického centra AV ČR v Českých Budějovicích. Zabýváme se zde výzkumem mikroskopických řas a sinic (souhrnně nazývanými fytoplankton) a ekologií člověkem vytvořených přehradních nádrží. Nádrže poskytují celou řadu důležitých ekosystémových služeb, např. jsou významnými zdroji vody pro vodárenství, zemědělství a průmysl, slouží k rekreaci či dopravě, nadlepšují průtoky a chrání nás před povodněmi.